Expression landscape of heterologous enzymes in Synechocystis sp. PCC 6803
该研究通过结合 split-GFP 报告系统与 Clp 蛋白酶抑制技术，首次定量揭示了异源酶在聚球藻 PCC 6803 中普遍存在严重降解现象，并证明替换为同源酶比优化遗传元件更能有效解决表达问题，从而为提升光合细胞工厂的产物产量提供了关键指导。
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synthetic biology
49 篇论文
合成生物学是一门将工程思维融入生命系统的迷人学科，它让科学家像设计电路一样重新编写和构建生物体。从设计能生产药物的微生物到创造可降解塑料的细菌，这一领域正在以前所未有的速度改变我们对生命的理解与应用方式。
在 Gist.Science 上，我们密切关注 bioRxiv 发布的每一篇相关预印本。我们的团队会对这些最新研究进行深度处理，提供既通俗易懂又保留关键细节的技术解读，帮助读者跨越专业术语的障碍，快速把握前沿动态。
以下为您精选了合成生物学领域最新发布的研究论文，它们代表了该方向上最激动人心的探索与发现。
Maximally Divergent Synonymous Gene Design with SIRIUS
本文介绍了一种名为 SIRIUS 的整数线性规划算法，旨在通过优化宿主特异性密码子使用偏好，生成共享子序列最少且高度分歧的同义基因序列，从而解决合成生物学中基因设计稳定性不足的问题。
Automated Knowledge Graph Construction for CAR T Cell Receptor Design via Hybrid Text Mining
本文提出了一种结合自然语言处理与大语言模型的自动化工作流，通过从 PubMed 文献中提取生物分子相互作用构建了首个 CAR-T 细胞信号传导知识图谱，为下一代嵌合抗原受体设计提供了结构化的知识基础。
Global Quantitative Analysis of Ligation Reactions in Self-Assembled DNA Nanostructures at the Single-Nick Level
该研究利用定量 PCR 技术在单切口水平上实现了对 DNA 折纸纳米结构中并行连接反应的全球定量分析，揭示了连接效率受酶对接概率影响而呈现边缘优于内部的分布规律，并发现 DMSO 共溶剂可消除这种差异，为 DNA 纳米结构从实验室走向实际应用提供了关键分析工具。
Mathematical modeling and sensitivity analysis of synNotch-CAR T-cells identify engineering targets for dynamic tunability
该研究通过构建微分方程模型对 synNotch-CAR T 细胞进行数学建模与全局敏感性分析，揭示了配体结合、自激活及下游启动子强度等关键参数，为优化癌症免疫疗法的动态可调性提供了工程化靶点。
A CURE for synthetic regulation of gene expression: Rapid screening of guide RNA efficacy as a framework for enabling undergraduate research in plant synthetic biology
该研究通过利用病毒载体快速筛选 gRNA 效率的创新技术，开发并验证了一个面向本科生的植物合成生物学课程式研究体验（CURE），使学生能够高效设计并筛选针对拟南芥 GID1 基因启动子的 CRISPR 转录抑制系统，从而克服了植物转化周期长这一传统障碍，为植物功能基因组学提供了有效的 gRNA 筛选框架。
AlphaFold Database expands to proteome-scale quaternary structures
该研究通过将 AlphaFold 数据库扩展至涵盖来自 4,777 种生物体的 180 万个高置信度蛋白质复合物，构建了首个大规模蛋白质组级四级结构资源，为解析生物分子相互作用及功能机制提供了基础性数据。
An expedient, biology-laboratory-compatible method for preparing functional perfluoropolyether fluorosurfactants for droplet microfluidics
该研究提出了一种无需酸氯中间体且适用于生物学实验室的简便方法，通过直接羰二亚胺偶联将功能化全氟聚醚（PFPE）与胺基头基结合制备氟表面活性剂，从而降低了生物微流控实验室对商业试剂的依赖并拓展了其在基因组筛选、热循环及蛋白质结晶等应用中的灵活性。
Transient contractility attenuation reprograms epithelial cells into a protrusion-driven state that drives tissue fluidization
该研究揭示，肌动球蛋白收缩力的瞬时减弱通过重塑细胞形态、力学特性及 ERK 介导的机械转导信号，将上皮细胞重编程为突起驱动的领导样状态，从而促使上皮组织从固态向液态转变。
Optimization of PURE system composition using automation and active learning
该研究结合自动化液体处理与主动学习框架，通过系统优化 PURE 体系组分，不仅显著提升了单一报告基因及大型合成染色体的蛋白表达效率，还揭示了不同 DNA 浓度及基因背景下优化策略的差异性，从而阐明了基因表达优化的机制并确立了主动学习在探索高维生物系统空间中的高效性。